幻之寶可夢。當他破蛋而出時誤將小遙當成媽媽，能憑借本能到達海之神殿。

小碼頭馬戲團的吉祥物，並能將脖子周圍的領巾部份膨脹以漂浮在水面。

海盜幻影的寶可夢，善於模仿人類語言。

被傑克捕獵，並將傑克送到了海之神殿。

一個立志成為寶可夢大師的男孩，他和他的夥伴皮卡丘一起踏上旅程。

小勝的姐姐，她決定和小智以及朋友們一起成為一名頂尖寶可夢協調訓練家。

小遙的弟弟。他夢想著成為一名像父親千里一樣的道館館主。

尼比道館前館主，出生於關都地區。他對寶可夢非常了解，而且是一個很好的廚師。

坂木率領的一個邪惡組織，目標是征服世界。成員武藏、小次郎和喵喵一直找機會收服小智的皮卡丘。

和寶可夢協力保護環境的寶可夢巡護員。和小智以及他的朋友們合力對抗海盜幻影。

水之民的孫子。是小碼頭馬戲團的水上明星，使用水屬性寶可夢進行精彩的表演。

實力雄厚的海盜頭目，使用潛艇之類的高科技機器來抓住瑪納霏的蛋，同時追逐小智和他的朋友們。

成員為廣美的家人，他們同時也是海之民的子孫。他們想借助小智以及他的朋友們幫助將瑪納霏送回亞克夏。